Výroční zpráva má dvě části – zprávu o činnosti a zprávu o hospodaření vysokých škol. Obsahem té první je popis struktury soustavy vysokých škol, jejich organizační struktury a řízení, popis vzdělávací, výzkumné a vývojové činnosti, hodnocení činnosti vysokých škol, zapojení škol do mezinárodní spolupráce ve vzdělávání a další. Zpráva o hospodaření shrnuje financování vysokých škol, zúčtování se státním rozpočtem, investiční rozpočet a jeho plnění.
Ze zprávy jasně vyplývá, že zájem uchazečů o studium na vysokých školách je každoročně vyšší. V roce 2004 se k přijímacím zkouškám dostavilo zhruba o 10 % více osob, než tomu bylo v loňském roce. Oproti roku 2003 studovalo na vysokých školách o 3 % více studentů, celkem 282 958 osob, z nichž více než 2 % studovalo ve dvou a více studijních programech. K výraznému nárůstu počtu studentů došlo zejména v bakalářských studijních programech, což dokazuje, že restrukturalizace studijních programů v duchu Boloňské deklarace je v ČR úspěšně realizována. Úspěšně byl na naprosté většině vysokých škol zaveden kreditový systém kompatibilní s European Credit Transfer Systém, který umožňuje zlepšit podmínky pro mobilitu studentů. Vysoké školy se v roce 2004 připravily na vydávání dodatku k diplomu, který v budoucnu přispěje k vyšší transparentnosti kvalifikace jejich absolventů. Vznikla první veřejná neuniverzitní vysoká škola – Vysoká škola polytechnická Jihlava.
Pokračoval rozvoj internacionalizace ve vysokoškolském vzdělávání, a to nejen nárůstem mobilit studentů a učitelů (vyjíždějících i přijíždějících), ale též uzavíráním dalších smluv o meziuniverzitní spolupráci se zahraničními institucemi a zapojováním českých vysokých škol do projektů v rámci programů EU.
Rozpočet vysokých škol v rámci kapitoly 333-MŠMT se oproti roku 2003 zvýšil o 2,661 mld. Kč na 19,018 mld. Kč. V důsledku toho mohl být financován kvantitativní rozvoj vysokého školství a MŠMT mohlo zahájit reformu vysokého školství. Průměrný plat zaměstnanců vysokých škol byl 21 278 Kč, z toho u akademických pracovníků dosáhl průměrný měsíční příjem 26 282 Kč.
Analýzy výročních zpráv vysokých škol využilo Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy při tvorbě svých koncepčních materiálů zaměřených na oblast vysokoškolského vzdělávání, zejména při přípravě Dlouhodobého záměru vzdělávací a vědecké, výzkumné, vývojové, umělecké a další tvůrčí činnosti pro oblast vysokých škol na období 2006 – 2010 a jeho Aktualizace pro rok 2006.
Lubomíra Černá, odbor vnějších vztahů a komunikace MŠMT